Nos Technologies pour Maximiser la Détection des Espèces

L’expertise VigiDNA® développée par SPYGEN repose sur les connaissances scientifiques accumulées depuis 2005 en matière de prélèvement et d’analyse de l’ADNe et est renforcée par 6 brevets internationaux.

Notre technologie vise à établir les standards de l’industrie pour la détection d’un large panel d’espèces, y compris les plus rares.

ADN environnemental

L’ADN environnemental (ADNe) est l’ADN qui peut être extrait d’échantillons environnementaux d’eau de mer, d’eau douce, voire de sol, sans jamais toucher, voir ou perturber les espèces ciblées.

Grâce à l’analyse de l’ADNe, nous pouvons identifier les espèces en collectant les traces d’ADN qu’elles laissent dans leur environnement.

Nos technologies ADNe sont particulièrement efficaces pour détecter les espèces rares, élusives ou cryptiques, qu’elles soient protégées, menacées ou invasives.

Elles permettent de réaliser des inventaires standardisés à grande échelle et à faible coût, sans impact négatif sur les écosystèmes.

Depuis 2008, cette méthode innovante a démontré son efficacité dans le domaine de la biologie de la conservation, notamment pour les inventaires et le suivi de la biodiversité.

Nos Innovations

Sur le Terrain

Nos technologies avancées garantissent un échantillonnage plus précis et plus complet.

Nous proposons des protocoles d’échantillonnage intégratifs, adaptés à chaque type d’environnement et optimisés pour la détection de l’ADNe rare. Ces protocoles sont complétés d’une gamme de kits d’échantillonnage à usage unique, conçus pour une utilisation simplifiée sur le terrain. Par exemple, nous avons développé des capsules de filtration haute capacité permettant de collecter davantage d’ADNe dans les milieux aquatiques.

Nos technologies permettent la conservation des échantillons à température ambiante, facilitant leur stockage et leur expédition vers nos laboratoires, tout en garantissant l’intégrité des échantillons.

Au Laboratoire

Nos protocoles d’extraction et d’amplification assurent un rendement plus élevé d’ADNe disponible pour le séquençage. Associés à une profondeur de séquençage importante (jusqu’à un million de séquences), nous minimisons les erreurs et renforçons notre capacité à détecter une vaste gamme d’espèces, y compris les plus rares.

Nos pratiques de laboratoire, protocoles et plateforme d’analyse sont optimisés pour la détection d’ADNe commun, rare ou dégradé, tout en assurant la prévention de la contamination des échantillons. Nous proposons des services de détection d’espèces cibles ou d’identification de groupes taxonomiques.

En Bioinformatique

SPYGEN dispose de l’une des plus grandes bases de références génétiques privées du marché, testée sur le terrain et vérifiée taxonomiquement, permettant les inventaires d’espèces les plus exhaustifs possibles.

Nous avons développé des outils bioinformatiques nous permettant de traiter et d’identifier les séquences d’ADN détectées. Nos bases de références génétiques, méticuleusement vérifiées et sélectionnées, permettent des assignations taxonomiques précises. Grâce à un effort de recherche interne constant et à des collaborations académiques, nos bases de données sont continuellement enrichies de nouvelles espèces.

Dans la Société

Animée par sa mission principale de comprendre et préserver la nature, SPYGEN s’engage à fournir des analyses fiables et des informations exploitables à un large éventail de clients, incluant des ONG, des institutions académiques, des organismes publics et des entreprises privées.

Pour garantir la plus haute qualité de service, nous restons à la pointe des avancées technologiques et scientifiques émergentes, en proposant des solutions sur mesure et innovantes pour chaque projet.

SPYGEN collabore avec des institutions académiques sur des études expérimentales, apportant son expertise et son accompagnement tout au long du processus – de la conception du protocole à la publication. Nous accompagnons également les acteurs du secteur privé dans l’évaluation de l’impact écologique de leurs activités.

Actifs dans la communication relative à la biodiversité au travers de guides, de publications et de conférences, nous contribuons au développement et au partage des meilleures pratiques en matière de suivi de la biodiversité.

Enfin, nous co-construisons avec nos clients des interfaces et plateformes numériques dédiées à l’échange et au suivi des données issues d’ADNe, en mettant l’accent sur la clarté visuelle et l’accessibilité afin de rendre les données de biodiversité plus lisibles et impactantes.

Outils et Kits d’Échantillonnage

Prélèvement d’Eau de Surface

Nos kits d’échantillonnage et capsules de filtration, associés à une gamme de pompes motorisées et manuelles, sont conçus pour une utilisation simple et efficace dans les environnements d’eau douce stagnante ou courante, ainsi que pour l’échantillonnage de surface en milieu marin. Pour les petites mares, nos filtres compacts permettent un échantillonnage simple, à moindre coût, tout en garantissant des résultats de haute qualité.

Échantillonneur Autonome (Micro-AUV)

En partenariat avec Seaber, nous avons conçu un véhicule sous-marin autonome (AUV) innovant. Compact et facile à déployer depuis un bateau ou depuis le rivage, cet appareil peut plonger jusqu’à 300 mètres de profondeur, suivre un parcours préprogrammé et corriger automatiquement sa trajectoire. Doté d’une autonomie de 10 heures et équipé de nos capsules de filtration haute capacité, il permet le prélèvement d’ADNe sur de vastes zones, couvrant plusieurs kilomètres en une seule mission.

Echantillonnage en Eau Profonde

Pour améliorer le suivi des espèces benthiques et profondes, nous avons développé, en collaboration avec nos partenaires, des pompes submersibles spécialement conçues pour la filtration en profondeur. Associées à nos capsules de filtration et à nos kits d’échantillonnage dédiés, ces pompes peuvent être déployées aussi bien depuis un navire que par un plongeur sous l’eau.

Autres Techniques d’Échantillonnage

Bien que l’analyse de l’eau soit au cœur de notre développement depuis de nombreuses années, nous avons élargi notre expertise en développant des solutions d’échantillonnage adaptées à d’autres matrices, notamment pour l’analyse des sols, des fèces et du miel. Conçus en accord avec notre politique qualité, nos kits sont optimisés pour un déploiement facile sur le terrain et un envoi sans contraintes vers nos laboratoires.

Sensibilisation à l’Échantillonnage sur le Terrain

Nous pouvons vous transmettre les connaissances théoriques nécessaires sur l’ADNe et vous sensibiliser à la collecte d’échantillons en toute autonomie.

Le prélèvement étant une étape clé du processus analytique de l’ADNe, SPYGEN collabore avec Synactile pour doter nos clients et partenaires de toutes les compétences indispensables à un échantillonnage efficace et à l’optimisation des résultats.

Grâce à une session de visioconférence accessible partout dans le monde, vous acquerrez une compréhension approfondie de la technologie et serez guidé dans l’application rigoureuse des protocoles d’échantillonnage de l’ADNe.

Découvrez Notre Partenariat

Échantillonnage sur le Terrain via Nos Partenaires

Nous pouvons vous aider à trouver un partenaire pour réaliser l’échantillonnage sur le terrain dans le cadre de votre projet.

Le réseau VigiDNA® regroupe des entreprises partenaires, notamment des bureaux d’études, experts dans la prestation de services en ADNe.

Ce réseau vise à rassembler les partenaires et les clients ayant collaboré avec SPYGEN depuis le début, et engagés à garantir la qualité des prestations fournies afin d’obtenir les meilleurs résultats possibles.