Groupes Biologiques et Organismes
Notre Offre
Détection d’Une Espèce Cible
Confirmez efficacement la présence d’une espèce cible avec l’analyse spécifique avancée de SPYGEN.
Cette approche spécifique affine la détection d’espèces aquatiques rares ou élusives, offrant une solution rentable en se concentrant sur une seule espèce cible.
- Découvrez la gamme complète des espèces disponibles pour la détection ciblée avec la technologie de SPYGEN : Aphanomyces astaci | Austropotamobius pallipes | Batrachochytrium salamandrivorans | Emys orbicularis | Lithobates catesbeianus | Misgurnus fossilis | Pelobates fuscus | Procambarus clarkii | Ranavirus | Triturus carnifex | Triturus cristatus | Triturus marmoratus | Xenopus laevis | Zingel asper | Neomys fodiens
Inventaire Global de Biodiversité
Obtenez une vision globale de la biodiversité grâce à l’approche innovante du metabarcoding de l’ADNe développée par SPYGEN. Nos inventaires de biodiversité, réalisés à partir l’une des plus grandes bases de références génétiques privées du secteur, sont parmi les plus robustes et exhaustifs du marché.
Idéale pour le suivi de groupes taxonomiques clés dans les écosystèmes d’eau douce, cette solution puissante identifie toutes les espèces d’un groupe cible – y compris les espèces rares, élusiv ou émergentes et invasives – fournissant un outil essentiel pour l’évaluation des écosystèmes, la conservation, la recherche et le reporting d’impact.
Détection des Espèces Rares
La technologie ADNe multi-brevetée de SPYGEN vise à établir les standards en matière de détection d’un large éventail d’espèces, y compris les plus rares. Alors que la plupart des entreprises se concentrent sur l’ADNe commun pour le suivi des espèces abondantes, SPYGEN a été dès le départ pionnier de l’ADNe de précision.
Cette approche exige des protocoles techniques rigoureux, tant sur le terrain qu’au laboratoire. Grâce à notre méthodologie avancée et à notre technologie de pointe, SPYGEN est aujourd’hui un leader mondial dans la détection de l’ADNe des espèces rares.
Détection des Espèces Invasives
La technologie ADNe améliore considérablement la détection précoce des espèces invasives. Comparée aux méthodes traditionnelles, l’ADNe permet d’identifier des individus invasifs sur un plus grand nombre de sites, et ce à moindre coût.
Cette capacité de détection précoce permet une action corrective rapide et contribue ainsi à limiter les dommages écologiques potentiels, car les espèces invasives peuvent rapidement perturber les habitats et supplanter les espèces natives.
Les programmes de surveillance basés sur l’ADNe offrent une détection anticipée des espèces invasives, permettant ainsi des réponses plus rapides et plus efficaces pour gérer, voire prévenir, les invasions.
Surveillance des Pathogènes
La technologie développée par SPYGEN est conçue pour détecter des pathogènes animaux spécifiques. Notre analyse porte actuellement sur trois pathogènes affectant les amphibiens ainsi qu’un pathogène spécifique à l’écrevisse. En permettant une surveillance précoce et précise grâce à l’ADNe, il devient possible d’initier rapidement des actions de réponse, limitant ainsi la propagation des agents pathogènes avant qu’ils n’impactent les espèces sensibles. Cette approche favorise une gestion plus efficace des écosystèmes.
Méthodes d’Échantillonnage
Aperçu des Méthodes d’Échantillonnage dans les Environnements d’Eau Douce
Le protocole d’échantillonnage est une étape essentielle du processus d’analyse de l’ADNe. Un protocole bien conçu améliore considérablement la quantité d’ADNe collectée dans l’environnement, ce qui permet d’obtenir des résultats plus précis.
Dans les écosystèmes lotiques, tels que les rivières, nous réalisons généralement deux filtrations de 30 litres d’eau par site. Les stations d’échantillonnage sont réparties tous les 2 kilomètres afin de garantir une évaluation fine et représentative de la biodiversité selon les besoins de l’utilisateur. Dans les milieux lenthiques (eaux stagnantes), nous recommandons de réaliser des transects au plus près des berges, en couvrant l’ensemble du périmètre pour maximiser la représentativité de l’échantillonnage.
Selon les groupes taxonomiques ciblés, nous vous accompagnons pour définir la période d’échantillonnage la plus pertinente, en fonction des cycles de reproduction et des pics d’activité des espèces.
Nous sommes à votre disposition pour vous aider à concevoir le protocole le plus adapté à votre projet, en tenant compte des contraintes éventuelles, des spécificités environnementales et de vos objectifs finaux. N’hésitez pas à nous contacter pour bénéficier de nos conseils.
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Échantillonnage en Milieux Courants – Rivières :
Selon la taille du cours d’eau, l’échantillonnage peut-être réalisé à pied ou à bord d’une embarcation.
Le protocole consiste à réaliser un échantillonnage en allers-retours d’une rive à l’autre tout en filtrant face au courant. Les stations d’échantillonnage doivent être soigneusement définies en fonction de la taille du cours d’eau et de sa dynamique hydrologique. 2 réplicats de terrain sont réalisés sur chaque site, ce qui signifie que 2 filtres à haute capacité sont utilisés, chacun filtrant 30 litres d’eau, soit un volume total de 60 litres par site.
En l’absence d’une embarcation et lorsque le cours d’eau n’est pas accessible, l’échantillonnage peut également être effectué depuis la berge à l’aide d’une perche adaptée.
Échantillonnage en Grands Milieux Stagnants :
Si votre site d’étude est un grand plan d’eau stagnant, tel qu’un lac ou un réservoir, et non un milieu courant, les transects doivent être réalisés depuis une petite embarcation se déplaçant lentement le long des berges. Ces grands plans d’eau stagnants sont généralement définis par un périmètre d’au moins 2 kilomètres et une superficie de 10 hectares ou plus.
Chaque transect ne doit pas dépasser 2 kilomètres et nécessite environ 30 minutes de filtration continue. Dans ces milieux stagnants, un seul filtre est utilisé par transect, permettant de filtrer jusqu’à 30 litres d’eau. Il est essentiel de rester au plus près des berges, idéalement à moins de 5 mètres, car c’est dans ces zones que la diversité des espèces et la concentration d’ADNe sont généralement les plus élevées.
Échantillonnage en Petits Milieux Stagnants :
Pour les petits plans d’eau stagnants de moins d’un hectare de surface et dont le périmètre est inférieur ou égal à 400 mètres, tels que les petites mares, étangs, marais et zones humides, nous utilisons un protocole d’échantillonnage ponctuel à la louche plutôt qu’une filtration continue par pompe. Le protocole consiste à prélever 20 sous-échantillons répartis de manière homogène sur l’ensemble du périmètre du plan d’eau, pour un volume total d’environ 2 litres.
